IT之家 11 月 16 日消息(xi)，瑞典斯德哥(ge)爾(er)摩大學的研究(jiu)團(tuan)隊首(shou)次(ci)從冰封 3.9 萬年的長毛(mao)猛(meng)犸(ma)象組織(zhi)中成(cheng)功分(fen)離(li)并測(ce)序(xu) RNA 分(fen)子。

這些 RNA 來源于西伯利亞永久凍土保存的樣本，是迄今為止人類獲得的最古老 RNA。相關成果已于 11 月 14 日發表在《細胞》上（IT之家附 DOI: 10.1016/j.cell.2025.10.025）。

研究顯(xian)示，不僅(jin) DNA 與蛋白質，RNA 也能夠在極(ji)端(duan)條件(jian)下長(chang)期(qi)保存，為研究早已滅絕物種的生物學特征提(ti)供(gong)新的信息。

論(lun)文第(di)一(yi)作(zuo)者、現(xian)就職于哥本哈根大(da)學(xue) Globe Institute 的(de)(de) Emilio Mármol 表示(shi)：“通(tong)過 RNA，我們(men)可以直接看到哪些基因(yin)處(chu)于‘開(kai)啟(qi)’狀態，讓我們(men)得以一(yi)窺這只生活(huo)在上一(yi)次(ci)冰(bing)河時期的(de)(de)猛犸象生命最后時刻(ke)的(de)(de)生理活(huo)動(dong)。這些信(xin)息僅靠 DNA 是無法獲得的(de)(de)。”

在(zai)斯(si)(si)德哥爾摩(mo)大(da)學(xue)(xue)工作(zuo)期(qi)間，他與(yu) SciLifeLab 及斯(si)(si)德哥爾摩(mo)大(da)學(xue)(xue)和瑞典自然歷史博物館(guan)共同牽頭(tou)的古(gu)遺傳(chuan)中心(xin)（Center for Palaeogenetics）開(kai)展合作(zuo)。長期(qi)以(yi)來，科學(xue)(xue)家不(bu)斷(duan)解析猛犸象 DNA 以(yi)重建其(qi)基(ji)因組與(yu)演(yan)化歷史，但 RNA—— 展示基(ji)因實際(ji)活動狀況的關鍵分子 —— 一直被視為過于易碎，難以(yi)跨(kua)越(yue)時間保存。

Mármol 指出，團(tuan)隊獲得了保存(cun)狀況極(ji)佳的(de)猛犸象組織樣本(ben)，因此希望其中仍(reng)能保留“被凍(dong)結(jie)的(de)”RNA 分(fen)子。研(yan)究(jiu)負責(ze)人之(zhi)一、斯(si)德哥爾(er)摩大學(xue)進化基(ji)因組學(xue)教授 Love Dalén 說：“我們(men)之(zhi)前曾將 DNA 的(de)可追溯極(ji)限(xian)推(tui)進到百萬(wan)年以(yi)上，而此次(ci)希望探索 RNA 是否(fou)也能突(tu)破既(ji)往研(yan)究(jiu)的(de)時間上限(xian)。”

最古老的 RNA 測序記錄

研究人員(yuan)在名(ming)為 Yuka 的(de)(de)幼年猛(meng)犸象(xiang)凍結肌肉組織中發現明確的(de)(de)組織特異性基(ji)因(yin)(yin)表達模式。盡(jin)管猛(meng)犸象(xiang)基(ji)因(yin)(yin)組包含 2 萬多個蛋白編碼(ma)基(ji)因(yin)(yin)，但并(bing)非(fei)全部(bu)處于(yu)活躍狀(zhuang)態。檢測到的(de)(de) RNA 主要與(yu)肌肉收(shou)縮(suo)以及應激(ji)狀(zhuang)況(kuang)下(xia)的(de)(de)新陳代謝調節有關。Mármol 表示(shi)：“我們發現了細胞(bao)應激(ji)的(de)(de)跡象(xiang)，這并(bing)不(bu)令人意外(wai)，先前研究顯(xian)示(shi) Yuka 在死亡前可能曾遭洞(dong)獅攻擊(ji)。”

團隊同時鑒定出大量與基因調控(kong)相關的(de) RNA 分(fen)(fen)子(zi)。斯德哥爾摩(mo)大學(xue) Wenner-Gren 分(fen)(fen)子(zi)生(sheng)物科學(xue)系副教(jiao)授、SciLifeLab 研(yan)究(jiu)員 Marc Friedl?nder 表示：“這(zhe)些不編碼蛋(dan)白的(de) RNA，例如微(wei)小 RNA（microRNAs），是我們最令(ling)人興奮的(de)發現之一。它們是古代(dai)肌(ji)肉組(zu)織中(zhong)(zhong)實時基因調控(kong)的(de)直(zhi)接證據，這(zhe)是首次在如此(ci)古老的(de)樣本中(zhong)(zhong)實現。”

來自挪威北極大學博物館的(de) Bastian Fromm 指出，這些微小 RNA 的(de)罕(han)見突變進一步(bu)確(que)認了樣(yang)本確(que)屬猛(meng)犸象來源，團隊甚至(zhi)僅依據(ju) RNA 證據(ju)鑒(jian)定(ding)出此前未知的(de)基因(yin)，“這在如此古老的(de)材料中尚屬首次”。

“RNA 能比過去認知的活得更久”

Dalén 表示(shi)：“我們的結果表明(ming)，RNA 分子(zi)可(ke)以比之前認為的存(cun)活得(de)更(geng)久(jiu)。這意味著我們不(bu)僅能(neng)夠研究滅絕動物中哪些基(ji)因處于‘開啟’狀態，未來甚至有可(ke)能(neng)測序保存(cun)于冰河時期遺骸中的古(gu)代 RNA 病毒(du)(du)，包括流感病毒(du)(du)和冠狀病毒(du)(du)。”

研究(jiu)(jiu)團隊希望(wang)未來能(neng)夠(gou)將史前 RNA 與 DNA、蛋白(bai)質及其他(ta)可保存的(de)(de)生物分子結合(he)研究(jiu)(jiu)。Mármol 總結道：“這些研究(jiu)(jiu)將有(you)望(wang)重塑我們對已滅絕巨型動物以及其他(ta)物種(zhong)的(de)(de)認識，揭示那些被時間凍結至今的(de)(de)層層生物學信(xin)息。”

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